本プロジェクトの実施にあたって、東京大学生産技術研究所計算科学技術連携研究センターを中核拠点に全国の大学（東京大学大学院工学系研究科、東京大学人工物工学研究センター、北海道大学大学院工学研究科、東北大学大学院工学研究科、慶應義塾大学理工学部）、国公立研究機関（国立医薬品食品衛生研究所、（独）物質・材料研究機構）および（財）高度情報科学技術研究機構、アドバンスソフト（株）などから総勢120名の優れた研究者が結集し、ソフトウェアの理論設計・概念設計を実施するとともにプロトタイプ・ソフトウェアの開発を行います。一方、東京大学国際・産学共同研究センター（通称：CCR）においてインキュベーションプロジェクトの認定を受けてユーザーインターフェースなど具備した実用的ソフトウェアの開発やマニュアルの作成などをベンチャー企業のアドバンスソフト(株)が実施しています。
