・	2004年9月17日(金)		第19回「戦略的基盤ソフトウエアの開発」ワークショップ ―次世代量子化学計算―を開催しました。
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・	2005年6月30日		ProteinMD-0.2のダウン ロードを開始しました。
・	2005年6月30日		プロテイン・エディタ-0.9のダウンロードを開始しました。
・	2005年6月20日		ProteinDF System β2のダウンロードを開始しました。
・	2005年6月20日		ProteinDF-0.9.12のダウンロードを開始しました。
・	2005年3月11日		ProteinDF System βのダウンロードを開始しました。
・	2005年3月11日		プロテイン・エディタ 0.9βのダウンロードを開始しました。
・	2004年6月30日		階層並列版QCLO-0.1ならびにProteinMD-0.1のダウンロードを開始しました。
・	2004年6月21日		ProteinDF-0.9.11ならびにPDBDataTool-0.1のダウンロードを開始しました。
・	2004年4月12日		計算結果を表示するグラフィクス・ツールにバグがあり、一時的にソフトウエア公開を中止しておりました。 バグ修正・検品・マニュアルの修正が完了いたしましたので、公開を再開いたしました。皆様にはご迷惑をお掛けいたしまして誠に申し訳ございません。なお、以前のパッケージのProteinDFで計算された結果には誤りはありません。
・	2004年2月10日		ProteinDF-0.9.10のダウンロードを開始しました。
・	2003年6月13日		ProteinDFのダウンロードを開始しました。

・	東京大学生産技術研究所 佐藤(文)研究室
・	計算科学技術連携研究センター
・	アドバンスソフト(株)

・	産学官連携研究員の牟田氏のインタビュー

大規模タンパク質の量子化学計算ソフトウェアProteinDFをベースに、1,000残基規模の超大規模量子化学計算が可能なソフトウェア、数十残基規模のタンパク質の量子分子動力学計算が可能なソフトウェア、ならびにこれらを容易かつ直感的に操作することができる統括環境を開発することを目標としている。

また、100残基規模の重要なタンパク質の全電子計算や構造最適化計算を系統的に実施し、タンパク質の電子状態と高精度の立体構造のデータベースを構築する。これらの目標をカップリングさせることによって、本ソフトウェア、データベースともに世界標準を目指す。